1、種子發芽室體內實際溫度與箱體顯示溫度和設定溫度之間都存在差異，箱體內實際溫度一般都小于箱體顯示溫度和設定溫度，在實際工作中需用溫濕度記錄儀來校正。
　　2、種子發芽室雖是采用微電腦控制技術、人工模擬自然生態環境的新型試驗設備，但箱內各層的溫度存在差異，同一層的里面和外面的溫度也存在差異，那些容積較大的培養箱內的各部位的溫度均是存在一定的差別的，在使用時應引起高度重視。
　　3、樣品數量較少和做水稻發芽檢測等體積較小的實驗時，應多使用容積較小、溫度較均勻的精密種子發芽箱。
　　4、從測量結果來看，種子發芽室的最上一層溫度并不是最高，溫度較高的是箱體中部。