農作物種子凈度檢測的注意事項，主要包括以下七個方面：
1、凈度檢測分析不只是要確定凈種子的存在比例，對其它植物種子和雜質的存在比例也要注重，因為只有這樣才能推測種子批的組成，并鑒別植物種子和雜質所屬的種類，從而為農業生產服務。
2、在凈度檢測分析中，只要是符合凈種子定義的，哪怕是未成熟的，瘦小的、秕粒的、皺縮的、帶病的或發過芽的種子單位都應列為凈種子。
3、在試樣分離時必須根據種子的明顯特征，對樣品中的各個單位進行仔細檢查和分析，并依據種子形態待方法盡可能加以鑒定。因此，檢驗室必須收集大量的種子標本進行對照，也可使用各種圖譜和檢索表。
4、在進行試樣分離時，如果送驗者要求檢驗是否存在指定的某些種時，只要發現一粒或數粒即可，并在報告單中加以說明。
5、當不同植物種之間區別困難或不可能區別時，則必須采用下列方法之一：
（1）在檢驗報告上僅填報屬名，該屬的全部種子均為凈種子，并加以附加說明；
（2）將相似的種子從其他成分中分離出來一起稱重。從這個混合物中隨機取出至少400粒種子，最好在1000粒種子左右；最后將這部分再分離，并測定每個種的重量比例。從這個比例可計算出每個種占整個樣品的百分率，并填報其詳細情況。
6、對于容許差距而言：若檢測分析的是兩份半試樣，檢測分析后的任一組分的相差不得超過《農作物種子檢驗規程》中規定的重復分析間的容許差距。若所有組分的實際差距都在容許范圍內，則計算各組分的平均值。如差距超過容許范圍，則按以下程序處理：
（1）再重新分析成對樣品，直到一對數值在容許范圍內為止（但全部分析不必超過4對）；
（2）凡一對間的差距超過容許差距兩位時，均應略去不計；
（3）各種組分百分率的最后記錄,應從全部保留的幾對加權平均數計算。 若檢測分析的是全試樣, 如在某種情況下有必要分析第二份試樣時,兩份試樣各組分的實際差距不得超過《農作物種子檢驗規》中規定的容許差距。如果所有組分都在容許范圍內，取其平均值。如果超過容許差距，應再分析一份試樣，若分析后的最高值和最低值差異沒有大于容許誤差2倍時，填報三者的平均值。如果結果中的一次或幾次顯然是由于差錯而不是由于隨機誤差而引起的，需將不準確的結果去除。
7、在填寫結果報告單時，對樣品重和結果計算中的試樣重應嚴格按照《農作物種子檢驗規程》中的有關小數點的表示方法進行記錄。最后應填好風選凈度儀等儀器設備使用記錄，將所用儀器設備關掉，切斷電源，儀器歸位。把多功能種子凈度工作臺打掃干凈。并將檢驗完的凈度供檢樣品整理好后送交樣品管理員保存。